L'adhésion à l'AACSB, le plus grand organisme mondial d'accréditation, comme membre et la reconnaissance des Diplômes par le CAMES (Conseil Africain et Malgache pour l'Enseignement Supérieur) nécessite pour HETEC, l'établissement d'une organisation administrative beaucoup plus proche de la réalité pédagogique. C'est dans ce cadre qu'ont été mis sur pied à HETEC, des Instituts qui ont pour mission principale : > Assurer l'encadrement pédagogique des etudiants à travers le suivi des enseignements et des enseignants, > Contrôler le niveau des étudiants et vérifier s'ils assimilent les cours à eux, dispensés.